真固生物结直肠癌伴随诊断产品多中心千人临床试验结果发布
发布时间:2021-04-27 10:39:30 访问次数:
2021年4月23日~24日HIT第三届热点肿瘤分子诊断技术与应用论坛于上海盛大开幕。作为肿瘤伴随诊断创新企业,真固生物携结直肠癌LC103试剂盒产品亮相本次大会。
真固生物研发总监王博-博士围绕”高通量测序IVD在结直肠癌伴随诊断方面的临床研究”专题展示了最新研究成果并进行报告。
真固生物作为美国pillar biosciences—SLIMamp®(Stem-Loop Inhibition Mediated amplification)多重PCR文库制备技术唯一技术授权合作商,其自主研发出结直肠癌伴随诊断的IVD产品——LC103试剂盒,可检测KRAS/NRAS/BRAF/PIK3CA等关键标志基因的突变。据悉,LC103包含22个目标基因,103个扩增子,对FFPE样本中的SNV和INDEL进行检测,最低起始量可低至2.5ng,最低检测下限可达0.6%,兼容Illumina、MGI和Ion Torrent三大测序平台。该IVD产品已在中美两地独立进行性能验证,平行开展多中心临床队列研究,并分别在NMPA和FDA进行注册申报,预计2021年第二季度可以获得FDA的批准,中国NMPA审批预计在2021年年底之前完成。
1 性能一致性
在纳入试验的1,106例样本中,共检测出阳性突变样本493例。与金标准检测结果进行比较,各基因的总体符合率均较好,Kappa系数均大于0.9,因此可认为两种方法高度一致,两种方法等效。
2 临床一致性
选取两个中心进行临床一致性研究,考核LC103与已经批准的伴随诊断试剂进行比较。阳性符合率为100.00%,阴性符合率99.36%,总符合率为99.54%。Kappa系数0.9885(> 0.9)说明两种方法检测结果高度一致,两种方法等效。
3 药物关联性评价
选取LC103检测结果为KRAS 野生型突变的样本,按照试验方案考查应受试者“西妥昔单抗”用药的客观缓解率(ORR)。
最终,客观缓解率达到65.38%,说明考核试剂检测结果与伴随药物的关联性较好(可接受范围60%~70%)。
4 基因突变情况
图1.基因突变情况分析
结果显示,在此中国人群结直肠癌队列中,TP53突变占比最高达到71.7%,其次是KRAS为45.3%和PIK3CA为19.9%。另外两个关键标志物NRAS 和 BRAF分别占比为4.8%和6.6%。其中KRAS的变异集中在12和13密码子,BRAF 的变异富集在热点V600E 变异上。考察基因突变之间的关联性发现,KRAS 与BRAF、KRAS 与NRAS 相互排斥,很少同时发生突变(p-value 3.0e-6, 6.1e-5)。
图2.突变基因关联性分析
错配修复通路完整的病例(412)占总病例(596)的68.9%,经计算发现PIK3CA和TP53 的突变在这些病例中富集。结合MMR状态以及PIK3CA等关键标志物的突变信息,可以用于鉴别特定病人亚群,对用药具有指导意义。
此外,王博博士表示,真固生物致力于长期持续地建设和完善以多重扩增技术为核心的NGS建库及生信分析技术平台、产品平台以及服务支持平台。在自研多重扩增NGS技术平台的基础上,既持续地推出以注册IVD为核心的NGS系列标准产品及IVD-LDT-RUO多层级定制服务,也为高性价比、高难度价格比要求的细分市场提供临检服务,最终实现为公众提供便捷的、价格可接受的二代测序产品和服务的目标。